Aktywność naukowa

Obszary aktywności naukowej

  • Biofizyka specyficznych oddziaływań białek i fragmentów kwasów nukleinowych RNA w procesach translacji, splicingu i transportu w komórkach.
  • Synteza chemiczna oligonukleotydowych analogów końca 5' mRNA i ich biologiczna funkcja w procesach ekspresji genu w eukariotach.
  • Stosowanie i rozwijanie metod relaksacyjnych i metod symulacji komputerowych do badania struktury, dynamiki i funkcjonowania biopolimerów i analiza właściwości wybranych układów biomolekularnych.
  • Rozwijanie i zastosowania wieloskalowych metod molekularnego modelowania i bioinformatyki.
  • Identyfikacja i charakterystyka struktury ligandów w miejscach aktywnych enzymów za pomocą spektroskopii emisyjnej: mechanizm aktywności fosforylaz nukleozydów purynowych i syntaz tymidylanowych.
  • Struktura i własności spektralne tylakoidów roślin wyższych.
  • Biofizyczne podstawy działania fosforylaz nukleozydów purynowych oraz synteza i badania biologiczne ich inhibitorów o potencjalnym znaczeniu farmakologicznym.

Metody eksperymentalne

  • spektroskopia molekularna (UV-VIS, emisja fluorescencji, stopped-flow, NMR, CD), dyfrakcja promieni X,
  • kalorymetria,
  • spektrometria masowa,
  • fotofizyka molekularna,
  • elektrochemia, chemia,
  • enzymologia,
  • inżynieria genetyczna.

Metody teoretyczne

  • mechanika i dynamika molekularna,
  • wieloskalowe metody molekularnego modelowania,
  • kwantowa dynamika,
  • bioinformatyka i biologia systemów.

Laboratoria i sprzęt

Standardowa aparatura niezbędna do pracy w laboratorium biofizycznym oraz nowoczesna aparatura zakupiona z projektow POIG:

  • Program Operacyjny Innowacyjna Gospodarka, Działanie 2.1 POIG.02.01.00-14-122/09. Fizyka u podstaw nowych technologii - rozwój nowoczesnej infrastruktury badawczej na Wydziale Fizyki Uniwersytetu Warszawskiego - Pracownia Biopolimerów
  • Program Operacyjny Innowacyjna Gospodarka, Działanie 2.2 POIG.02.02.00-00-025/09. Krajowe Laboratorium Multidyscyplinarne Nanomateriałów Funkcjonalnych - Laboratorium Ultrawirowania Analitycznego

Pracownia Biopolimerów

Laboratorium Ultrawirowania Analitycznego

Grupy badawcze i projekty

Badania struktur makromolekularnych, ich dynamiki i funkcji

Struktura przestrzenna i molekularny mechanizm katalizy białek z rodziny fosforylaz nukleozydów purynowych

Rola końców 5' mRNA i 5' U snRNA (tzw. struktur kapu) w regulacji ekspresji genu

Rozwijanie i zastosowania wieloskalowych metod molekularnego modelowania i bioinformatyki